José Henrique Fonseca é um cineasta e diretor brasileiro.
Dirige comerciais e videoclipes da Conspiração Filmes, produtora que fundou junto com Lula Buarque de Hollanda, Cláudio Torres e Arthur Fontes. É filho do escritor Rubem Fonseca e casado com a atriz Cláudia Abreu desde 1997, com quem tem três filhos, Maria, Felipa e José Joaquim.
Formou-se em direito na Faculdade Cândido Mendes, mas escolheu o cinema e o audiovisual como seu meio de trabalho.
Dirigiu uma série para televisão, Agosto (co-dirigida com Paulo José), antes de estrear no cinema, com o episódio Cachorro!, do longa-metragem Traição (1998). Estreou em longa-metragem em O Homem do Ano (2003), que tem como protagonista um policial inspirado em romance de Patrícia Melo, com roteiro escrito em parceria com Rubem Fonseca e Patricia Melo, uma co-produção da Conspiração Filmes com a Warner.
Participou do Festival de Berlim de 2003 e recebeu o prêmio de melhor primeiro filme no Festival de São Francisco de 2003.
Em 2005, dirigiu e produziu em parceria com a HBO a série Mandrake, baseada nos contos escritos por seu pai nos quais o advogado criminalista Mandrake era o protagonista. Seu próximo projeto é o longa Heleno – o homem que chutava com a cabeça, baseado na vida do jogador de futebol Heleno de Freitas.