No ano de 1886, alguns pescadores do porto de Nova Inglaterra, Estados Unidos, presenciam uma "criatura de origem desconhecida" destruindo navios de pesca e de guerra. Para tentar desvendar o mistério, chamam Pierre Aronnax, um professor especialista em coisas do fundo do mar e Ned Lond, um experiente marinheiro, se unem para descobrir a verdade sobre o "monstro" que estava aterrorizando os mares. Baseado no livro do grande escritor Julio Verne, este desenho animado mostra as sinistras viagens nas profundezas do mar, com o Capitão Nemo a bordo do seu submarino Nautilus.