Junior, juntamente com sua irmã, filhos do cantor Xororó, da dupla sertaneja Chitãozinho & Xororó, se apresentaram pela primeira vez em 1989, no programa Som Brasil e, um ano depois, gravaram seu primeiro álbum, "Aniversário do Tatu", que foi lançado em 1991, alcançando, em menos de um mês, a vendagem de 250.000 cópias.

Após uma carreira de grande sucesso, a dupla anunciou o fim em 2007, depois de 17 anos juntos.

Junior integrou em uma banda de Black Music chamada SoulFunk, na qual era baterista e vocalista. A banda encerrou suas atividades em julho de 2007, para que Junior pudesse se dedicar à sua última turnê com Sandy, "Acústico MTV". Além de tocar diversos instrumentos musicais, como guitarra elétrica, violão e bateria, também atua como compositor e arranjador. Em 5 de setembro de 2008, Junior anunciou seu novo projeto musical, a banda Nove Mil Anjos. Formada por Junior Lima na bateria, Champignon no baixo, Peu Sousa na guitarra e Péricles Carpigiani, o Perí, nos vocais. No mesmo ano a banda lançou o álbum "9MA". Em setembro de 2009 a banda Nove Mil Anjos anunciou o fim de suas atividades. Após o 9MA, Junior Lima fez algumas apresentações com a dupla de música eletrônica Crossover, que é integrada por Amon Lima e o DJ Júlio Torres. Desde 2009, Junior faz apresentações de música eletrônica, também com esta dupla, porém, agora, com o codinome Dexterz. Neste trio, ele é responsável por tocar, principalmente, bateria. Além de objetos inovadores, como um ipad para fazer música. O Dexterz é o trabalho mais atual do músico até então. O primeiro single do Dexterz é uma música chamada Children.