Jon Schaffer é o guitarrista, líder e único membro remanescente da formação original da banda de heavy metal americana Iced Earth.

Com 14 anos de idade Jon adquiriu o seu primeiro violão e começou a compor. Com 16 anos de idade ele deixou a Alta Escola Northrop, em Forte Wayne, Indiana e abandonou a casa dos pais em Tampa, Flórida, para seguir com seus objetivos de músico. Em 1985 Schaffer fundou o Purgatory, que passou a se chamar Iced Earth. Sendo hoje em dia o último membro da formação original, e o principal compositor da banda. Jon sofreu de danos no pescoço, alguns dos quais resultaram em cirurgia. Em 2005, Jon e sua esposa, Wendi, tiveram sua primeira filha.

Jon Também é cunhado de Matthew Barlow, ex-vocalista da banda, Barlow está casado com a irmã de Schaffer.

Schaffer também se apresenta ao vivo na banda Demons and Wizards, o seu projeto paralelo com o vocalista Hansi Kürsch.

Schaffer também canta as canções “Stormrider” de "Night of the Stormrider” e em “God of Thunder”, um cover do Kiss, em "Tribute to the Gods". Ele também executa duetos em algumas músicas da banda, como, “A Gift Or A Curse”, “Desert Rain”, “Burnt Offerings”, “Gettysburg (1863) - High Water Mark”, “Attila”, dono de uma voz forte e rasgada, mas também canta alto de modo suave, e faz um ótimo backing vocal. Em estúdio toca outros instrumentos, já tendo tocado Baixo, Teclado, bandolim.

As influências musicais de Jon Schaffer foram o Kiss, Iron Maiden, Judas Priest, Metallica, Blue Öyster Cult, Alice Cooper, Black Sabbath, e AC/DC. Os seus passatempos prediletos incluem motocicletas e Schaffer também é um fanático por História, principalmente pela Guerra Civil Americana, mais precisamente a Batalha de Gettysburg, que inspirou a sua canção mais longa até agora, a composição musical de 32 minutos, "Gettysburg (1863)". Liricamente, Jon é inspirado por fantasia, ficção científica, história e literatura de horror, e conhecido por ser um colecionador de Star Wars.

Além da música, Jon Schaffer possui uma loja para colecionadores e fanáticos por história, chamada "Spirit of '76 Collectibles", localizada em Columbus, Indiana.