Kong volta a reinar nessa aventura e está ainda mais forte e poderoso. O gorila gigante, é o soberano de uma ilha. Tudo muda quando uma antiga profecia se torna realidade, e a civilização de Atlântida levanta-se do fundo do mar. Reptilla, deseja fazer de Kong seu parceiro. Jason e seus aliados decidem impedir os planos de Reptilla e salvar Kong e sua ilha.