Shintaro Kisaragi, um HikiNEET que se trancou em seu quarto por dois anos, esteve vivendo sua vida normalmente até conhecer uma garota virtual chamada Ene, que aparece na tela de seu computador quando alguém anonimamente o envia um misterioso e-mail um ano atrás. Um dia, Ene estraga o PC de Shintaro forçando-o a sair pela primeira vez em dois anos.