A última temporada convencional de Scrubs, segue o oitavo e último ano de J.D. no hospital Sacred Heart. Após a saída de Dr. Kelso do hospital, Dr. Cox é promovido ao cargo de Chefe de Medicina. J.D. e Elliot voltam a ser um casal, e o Zelador se casa com sua namorada Lady. Turk é promovido a Chefe de Cirurgia do hospital.