NEPHILIM começa com os primeiros sinais de guerra evoluindo entre o bem e o mal. Conjunto em tempos modernos, dois arcanjos, um sacerdote atípico, um detetive de homicídios-ex e uma forma de espírito ressuscitado uma improvável aliança para unir-se contra uma insurgência dos anjos caídos e a finalização do livre-arbítrio. Está escrito que a batalha final é destinada quando as sementes para a raça dos Nefilins foram plantadas por Beshwa, o primeiro anjo caído para acasalar-se com seres humanos durante os tempos antigos na terra. Agora, Markus pai deve liderar a batalha contra Azazel, um anjo caído, que pretende criar uma nova raça de Nephilim. Se nasceu, a nova raça irá prevalecer sobre todos os mortais e wreak o havoc absoluto e mal imparável. De fato, com o nascimento dos Nefilins, uma batalha final entre o bem e o mal está prestes a começar.