A turma vai fazer uma viagem para buscar a irmã mais nova de Velma, Madelyn. Ela foi estudar magia na Academia de Mágica Merlin, onde aparentemente houve alguns problemas, como a aparição medonha de um grifo gigante do mal que está amedrontando e afugentando todos os alunos da escola.

Para não perderem o costume, a Mistério S.A. resolve então ajudar Madelyn e seus amigos, tentanto desvendar o mistério que ronda o colégio de mágica.