A segunda temporada de Superman & Lois começa com a poeira ainda se abaixando em Smallville após as consequências chocantes do confronto entre Tal-Rho e Superman. O perfil nacional de Smallville está crescendo... mas algo abaixo da superfície irá espalhar ondas de choque pela cidade, e pode dar início ao fim de tudo. Na Gazeta de Smallville, Lois Lane e Chrissy Beppo ficam divididas quando uma antiga história com uma conexão pessoal com Lois a alcança, fazendo-a questionar sua credibilidade profissional.

Os filhos Kent também se encontram lidando com mudanças. O atleta Jonathan Kent enfrenta novos desafios no campo de futebol que o fazem tomar ações questionáveis, enquanto os segredos pessoais de Jordan e Sarah Cushing ameaça seu relacionamento.