O anime mostra os bons e maus momentos, as alegrias e tristezas do primeiro amor e do romance adolescente. Seis estudantes lutam para encontrar o seu verdadeiro amor e os seus únicos inimigos são as suas limitações adolescentes.

Cada episódio começa e acaba com uma citação filosófica que resume o conteúdo do episódio. Boys Be…, embora centrado em Kyoichi e Chiharu, conta a história das sete ou oito personagens principais e da sua vida amorosa.