Bubblegum Crash! inicia 1 ano após a crise começar. Em Tokyo, há agora os "boomers", que são robôs que fazem os serviços pesados e perigosos para os humanos. Mas eles saem do controle as vezes e cometem crimes. Uma nova onda de crimes causados pelos "boomers" fazem as Knight Sabers entrarem novamente em atividade. Knight Sabers é um grupo de garotas que lutam contra os boomers loucos.