Carlos, Rei Imperador, conta a história de um dos homens mais poderosos que a Europa já conheceu, governador de um império de tais proporções extraordinárias como a sua diversidade. Quando a Igreja Católica Romana enfrenta os novos desafios do Protestantismo no Norte da Europa e do Paganismo nas Américas. Carlos I da Espanha e V da Alemanha busca garantir o poder da Igreja.