A história se passa no início do século 21. Nesse mundo alternativo, o shogunato Tokugawa nunca perdeu o poder e o Japão manteve seu isolamento do resto do mundo. O 25º shogun assumiu o manto da liderança do Japão há 20 anos e o conselho estudantil impõe a supressão de elementos rebeldes em uma academia para crianças de famílias de militares, no sopé do Monte Fuji. As meninas Yukimura Sanada e Matabei Gotou batalham contra a facção dominante do conselho estudantil liderada por Tokugawa Sen, Hattori Hanzou, e outros.