Num futuro próximo, a economia entrou em colapso e o país se tornou um gueto.
Uma agência secreta “Gokuraku” foi criada pelo governo. A missão secreta de Aya e Chinatsu é lutar contra uma das maiores empresas internacionais “Kuroda Group”. Agentes secretos são chamados de “Lady Ninja” e usam uma ferramenta tradicional japonesa chamada “sangoku” e derrotam o mal.. No entanto, um dia "Yasha" o inimigo mais poderoso aparece na frente da Lady Ninjas. Quem vai sobreviver? A luta de Lady ninjas por um futuro melhor do país começa.