Little DJ passa-se numa pequena vila litorânea de Hokkaido em 1977 e conta a história de Takano Tarou, um garoto de 12 anos apaixonado por beisebol e rádio. Tarou adoece e acaba sendo internado, descobrindo que tinha um outro talento além do beisebol: Ser DJ. Com o incentivo de seu médico ele passa a fazer transmissões para os pacientes do hospital. Após algum tempo seu show se torna um grande sucesso, fazendo com que Tarou receba pedidos musicais e conheça várias pessoas, dentre elas o seu primeiro amor... Uma garota chamada Umino Tamaki que é um ano mais velha que ele.