A segunda temporada aborda a feroz luta dos cavaleiros contra Pallas, irmã caçula de Atena por quem nutre um profundo rancor desde eras mitológicas. A inimiga é auxiliada por seus leais súditos, os Pallasitos, guerreiros capazes de controlar o tempo, cujas armaduras são feitas de paládio, um mineral muito resistente. Enquanto os cavaleiros buscam uma maneira de cortar o forte laço que prende Atena a Pallas, Saori tem maus presságios sobre as batalhas vindouras. Em seus sonhos, a deusa Atena vê a derrota de seus cavaleiros, principalmente Kouga e Seiya. Os cavaleiros estão preocupados porque o tempo de vida de Saori está se esgotando e seu exército está em menor número, devido ao último confronto contra Marte. Eis que os Cavaleiros de Aço ressurgem para ajudá-los e dentre eles, Subaru é o que se destaca; mas diferente de seus companheiros, o jovem não tem interesse em proteger os fracos, e sim em derrotar Kouga e tornar-se um deus. O objetivo dos cavaleiros não é apenas libertar Atena do terrível destino que a une a Pallas, e sim salvar os humanos de outra calamidade. Há indícios que um poderoso deus está agindo às sombras e os Cavaleiros Lendários ressurgem para ajudar nossos heróis...