O mundo está sendo atacado pelos misteriosos "Victims", esses monstros gigantes do espaço querem destruir Zion e todos os seus habitantes. A única defesa de Zion são as 5 Deusas, robos sensitivos, cada qual destinado ao seu próprio piloto e reparadora. Com uma alta taxa de substituição de pilotos, fica a cargo da Academia para as Deusas (GOA) treinar jovens candidatos com uma habilidade, chamada EX, para um dia tornarem-se um piloto para uma Deusa. O candidato de número 88 - Zero acabou de entrar para a GOA e grandes mistérios e obscuros segredos o aguardam. Os pilotos, os candidatos, as Deusas Ingrid como os Victims estão prontos para atacar.