No antigo Japão, um lorde é assassinado e seu trono usurpado pelo maligno Yuki Daijo, que conta com a ajuda do feiticeiro Orochimaru. Mas o filho do lorde, Ikazuchimaru, é resgatado da morte por um misterioso pássaro gigante que o leva até uma isolada ilha. Lá, sob os cuidados de um velho mestre, Ikazuchimaru passa 10 anos aprendendo técnicas ninja. E quando Orochimaru reaparece, trazendo seu passado à tona, Orochimaru parte em busca para vingar a morte de seus pais.