Zaytoun conta a história de Yoni e Fahed, dois exilados de uma terra dividida. Quando Yoni - um piloto de caça israelense - tem seu avião derrubado sobre o Líbano e é capturado, ele recorre à ajuda de Fahed - um jovem palestino com raiva - em sua tentativa de alcançar a segurança. Juntos, eles viajam através de um país hostil, lutando com seu ódio e dependência mútuos, ambos buscando a sua própria ideia de casa.