Um pacato professor primário (vivido pelo ator Sho Aikawa) vive uma rotina cansativa e repleta de problemas familiares, sendo obcecado por um herói de sua infância chamado Zebraman, cuja série de TV fora cancelada há vários anos sem explicação. Então, para fugir dos seus problemas e lutar pela justiça, ele resolve se fantasiar de Zebraman e sair em busca de missões a cumprir. Mas a situação fica mais bizarra ainda quando surgem supervilões alienígenas para dominar a Terra...