Fernando iniciou a sua carreira no jornalismo em 1957, na Organização Victor Costa, que abrangia as rádios Nacional, Excelsior e Cultura. Depois, passou pela Rádio Difusora e pelo Estadão, atuando como copydesk.

Anos mais tarde, foi contratado pela TV Excelsior, onde foi editor e apresentador do “Show de Notícias”. Após o golpe de 1964, passou a trabalhar em Londres no Serviço Brasileiro da BBC.

Voltou ao Brasil em 1968 para trabalhar na TV Cultura, onde ajudou a montar a redação da emissora. Em 1974, se transferiu para a TV Globo, e por lá trabalhou como editor do Jornal Nacional e como diretor do Globo Repórter.

Depois da Globo, o jornalista ainda trabalhou como correspondente da IstoÉ e da Editora Abril, e na sequência passou a atuar como assessor de imprensa.

Fernando Pacheco Jordão escreveu “Dossiê Herzog – Prisão, Tortura e Morte no Brasil”, documento fundamental para a história do Brasil.