Em 1972 tinha 36 anos e viajava com a mulher, Liliana Methol, para celebrar o 12º aniversário de casamento em Santiago. Javier Methol e a esposa viajaram no mesmo voo que o primo dele, Francisco Abal, jogador do Old Christians. O casal, que tinha quatro filhos na época, sobreviveu à queda do avião. Porém, duas semanas após o acidente, ela morreu soterrada pela avalanche que deixou, ao todo, oito mortos. Após ser resgatado, Javier se casou com Anna Maria de Amorrortu e teve mais quatro filhos.