A história de Devil Survivor 2 gira em torno de um aplicativo pare celular chamado Nicaea, onde você se cadastra e aparece um vídeo de sua morte, o que muitos levam na brincadeira, só que isso acaba sendo real. Hibiki e Daichi, dois amigos próximos, um dia voltando de uma prova, recebem um e-mail com um vídeo no qual os dois estariam morrendo em um acidente de metrô, os dois já na estação, tentam fugir, mas só que o inevitável acontece. Após essa tragédia, eles recebem uma invitação, perguntando se eles queriam viver ou morrer, ambos escolhem a vida. Só que após se levantarem, vêem uma menina que também estava na estação, ser atacada por monstros. E então do celular da garota, é invocado um demônio que os ajuda a derrotar os que estavam atacando-lhes. Quando eles voltam para superfície, percebem que tudo mudou, a cidade agora são apenas ruínas de algo que já foi. O apocalipse está solto em um jogo de sobrevivência