Seu início foi na Rádio ABC, de Santo André. Depois trabalhou em vários outros veículos. Foi da Gazeta Esportiva, Rádio Gazeta, TV Gazeta, Rádio Record, onde formou uma equipe esportiva especial, tendo Silvio Luiz e Pedro Luiz ao seu lado. Nessa época, Flávio Prado e Silvio Luiz candidataram-se por duas vezes para a presidência da Federação Paulista de Futebol. Mas o fizeram de forma jocosa, tanto que na primeira vez foram para a sede em uma charrete e na segunda vez em um ambulância. Diziam que estavam lá para salvar o futebol brasileiro. Na Rede Record, ele também trabalhou na equipe esportiva.

Na TV Bandeirantes, Flávio Prado passou a ser comentarista internacional. Depois, marcou época na TV Cultura, onde apresentou o "Cartão Verde". Em seguida, foi para a Gazeta Esportiva e para a TV Gazeta.

No rádio, em 1990, foi contratado pela Rádio Jovem Pan, no começo como repórter, depois como apresentador e comentarista. Na Pan também apresenta o programa: " No Mundo da Bola".

Atualmente, ainda na TV Gazeta, apresenta a tradicional Mesa Redonda aos domingos. E participa do programa Gazeta Esportiva, durante a semana.

Foi o idealizador do Troféu Mesa Redonda, grande prêmio do futebol brasileiro, organizado pela TV Gazeta desde 2004.

Flávio Prado é casado e tem dois filhos: Rita Graziella Vaz Martone do Prado, cantora de pop e rock e Bruno Prado, jornalista esportivo.