Sete meses após os eventos de Mobile Suit Gundam Unicorn, a história se concentra em dois ex-Principado de Zeon remanescentes, Arlette Almage, antigo desenvolvedor de armas e ex-piloto de teste Danton Hyleg. Ambos são contratados pela equipe de pesquisa das Forças da Federação da Terra para investigar os restos do asteroide da base do Eixo. Mas após a sua chegada, eles encontram um Cyber Newtype, Quentin Fermo, que pilota o misterioso traje móvel, o RX-78AN-01 Gundam AN-01. Tristan ataca-os por razões desconhecidas.
-Mobile Suit Gundam: Twilight A AXIS é uma série japonesa escrita por Kōjirō Nakamura e ilustrada pela ARK Performance, lançada pela Sunrise sob o selo Yatate Bunko.