Um misterioso guerreiro africano aparece... Mukara.
Com a aparição deste guerreiro, as armaduras dos samurais são “possuídas” e obrigam os Samurai Warriors a lutarem contra elas. Tal fenômeno estranho está ligado a existência de uma armadura negra que é idêntica à Armadura do Sol/Inferno de Ryo/Hector. Capaz de utilizar esta Armadura Negra, Mukara desafia os Samurai para a batalha.
Agora, os Samurai Warriors precisam salvar o mundo lutando o contra o inimigo e o desejo de lutar das suas próprias armaduras.